Der DGP-Vorstand besteht i.d.R. aus 13 Mitgliedern. Es handelt sich um den amtierenden Vorsitzenden, den stellvertretenden Vorsitzenden, das Geschäftsführende Vorstandsmitglied, den Tagungspräsidenten, den designierten Tagungspräsidenten, das Nachwuchsmitglied sowie sieben Beisitzer. Die Amtszeit der Beisitzer sowie des amtierenden/stellvertretenden Vorsitzenden beträgt satzungsgemäß jeweils zwei Jahre. Das Geschäftsführende Vorstandsmitglied wird auf unbestimmte Zeit gewählt, die Tagungspräsidenten werden jeweils nur für ein Jahr bestimmt. Alle Vorstandsmitglieder werden von der Mitgliederversammlung gewählt.
Vorstand im Sinne des § 26 BGB sind der amtierende Vorsitzende, der stellvertretende Vorsitzende und der Geschäftsführende Vorstandsmitglied. Sie vertreten die Gesellschaft gerichtlich und außergerichtlich. Jeder der genannten Vorstandsmitglieder hat Einzelvertretungsbefugnis. Seit der 103. Jahrestagung im Jahr 2019 führt Herr Prof. Dr. med. Gustavo Baretton (Dresden) die Geschäfte des amtierenden Vorsitzenden. Als Geschäftsführendes Vorstandsmitglied steht ihm der DGP-Generalsekretär Herr Jörg Maas (Berlin) zur Seite. Herr Prof. Dr. med. Christoph Röcken wurde von der Mitgliederversammlung im Jahr 2018 zum neuen stellvertretenden Vorsitzenden gewählt und in 2020 in seinem Amt bestätigt.
Des Weiteren wählt die Mitgliederversammlung der DGP in jedem Jahr zwei Rechnungsprüfer, welche die Buchaltung des Vereins und der Rudolf-Virchow-Stiftung überprüfen und den Vorstand und die Mitgliederversammlung bei Haushaltsfragen beraten und Empfehlungen aussprechen. Derzeit sind dies:
Herr Prof. Dr. med. Hermann Herbst (Berlin)
Herr Prof. Dr. med. Carsten Denkert (Marburg)